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必扬医药近期参加了OpenADMET PXR 诱导活性预测盲测挑战赛, 本次挑战赛由 OpenADMET 主办(2026.04.01至2026.07.01)。在超过350名参赛者中,我们团队荣获第8名。
OpenADMET是一项旨在构建 ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)属性预测模型并探究其内在机制的开放式项目。该项目由多家机构(如 ARPA-H、盖茨基金会)联合支持,并由开放分子软件基金会(OMSF)负责管理。
作为一种感应外源物质的核受体,PXR 统筹调控药物代谢酶和转运体的转录。它是 CYP3A4 的主要调节因子,而 CYP3A4 是一种负责约 50% 上市药物生物转化的细胞色素 P450 亚型。非预期的 PXR 激活可能引发不良后果,包括因联合用药浓度低于治疗水平而导致的具有临床意义的药物-药物相互作用、由反应性代谢产物引发的肝毒性,以及耐药性。
早期预测 PXR 的诱导活性极具挑战性。PXR 拥有一个较大且高度灵活的结合口袋,能够容纳多种多样的化学结构,这使其被称为“变形者”,难以进行简单的建模预测。此外,可靠的数据稀缺,高质量的测量数据有限,导致该受体的重要性与可供研究的资源之间存在巨大的鸿沟。

图1. 数据集构建流程. (数据源: 挑战赛官方网站)
OpenADMET 利用一种低成本、高保真的内部检测方法,生成了包含超过 11,000 种化合物的 PXR 诱导数据集。总体而言,这是目前规模最大的公开 PXR 活性数据集。数据集的构建流程如图 1 所示。更多详情请参阅挑战赛官方网站。
本次挑战赛吸引了来自工业界和学术界的350多名参与者。我们团队(username: Multi)在竞赛中荣获第8名(见图2)。预测性能归功于严谨的数据准备和稳健的模型训练(见模型报告)。我们将在OpenADMET 挑战赛后续的论文中分享完整的方法论与流程细节。

图2. 最终活性预测排行榜